在未来的2070年6月，世界开始陆续出现未知的怪兽和异形，对人们的生存造成了重大的影响，巨兽危机爆发。地球危机合作组织（EarthCrisis?CooperationOrganization，简称ECCO）应运而生，在ECCO的主导下，世界各地开始对抗这些巨兽和异形。在这样的情况下，A国的光辉市留学生余承男一边用日记的形式记下他在这段时间下他所看到的世界。2070年10月下旬，光辉市中的其中一个避难所，也就是余承男所在的威克星顿地铁站被异形攻破。不得已下余承男和朋友们展开逃亡，后被名为晨曦的神秘女子所救，并成为了“赤色龙魂”的主人。从这时开始，他的命运产生巨大转变，并开始了他人生的另一场旅途。